明朝建立以后，道教承宋元旧制，分为正一、全真两大派系，官方发给不同的度牒。明朝皇室因鉴于世居龙虎山张陵后裔在道教中的影响，一方面肯定了元代授正一道教主的地位，但又革除“天师”称号，改授为正一嗣教真人。在明代皇帝中，特别崇奉道教的明世宗（朱厚熜1522—1566年在位），他自号“玄都境万寿帝君”，躬亲礼斋，许多道事士被授予“少保”、“礼部尚书”等官衔，参与朝政。明代历世还在京师设置道箓司，在各府设置道正司，在各县设置道会司，将道教事务列入朝廷行政管理的范围。
    明朝正一道的政治地位居道教各派之首。早在1361年朱元璋攻占南昌时，正一道第42代天师张正常就曾谴使拜谒，密告“符命”，与朱氏接上关系。明朝开国后，张正常于洪武元年（1368年）入朝礼贺，明太祖封他为正一嗣教真人，赐银印，秩视二品。洪武五年，又敕令张氏永掌天下道教事。从此正一天师便上升为道教各派首领，其地位较元代正一天师统领江南道教更高。张正常以擅长符水治病术闻名，羽化于洪武十年（1377年）。其子张宇初嗣位后，袭封正一嗣教大真人，领道教事。此后明朝历代天师皆沿例袭封大真人，掌管天下道教。张宇初博学能文，撰有《道门十规》。该书吸收全真道性命双修及严守清规戒律之宗旨，指出道士应遵守的10条戒律，以之推广于道教各派，意图整顿道教。他还撰有诗文集《岘泉集》，对道教思想宗旨及修持方法多所发挥，堪称宋元以来最有学识的正一天师。张宇初还曾奉敕设醮建斋，重建龙虎山上清宫。
     明太祖认为禅宗与全真道“以修身养性，独为自己而习”，无助于伦理教化，故重视正一而贬抑全真。因此全真道在明代政治地位下降，教团发展受限制，其势力远不及金元时代。
    全真道自元代以来，七真门下各自开派，形成7个支派。其中丘处机所开龙门派势力最强。该派传至明代，出现以戒律密传的“龙门律宗”。此宗以丘处机门人赵道坚为第一代律师，赵传张德纯，张传陈通微，陈传周玄朴。周玄朴是龙门第四代律师，受法于洪武丁卯（1387年）。周玄朴后传于张静定、沈静圆，龙门律宗此后分作张、沈二支流衍。